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干细胞按能力可以分为以下四类:
1.全能干细胞
由卵和精细胞的融合产生受精卵。而受精卵在形成胚胎过程中四细胞期之前任一细胞皆是全能干细胞。具有发展成独立个体的能力。也就是说能发展成一个个体的细胞就称为全能干细胞。
2.万能干细胞
是全能干细胞的后裔，无法发育成一个个体，但具有可以发育成多种组织的能力的细胞。
3.多能干细胞
只能分化成特定组织或器官等特定族群的细胞（例如血细胞，包括红血细胞、白血细胞和血小板）。
4.专一性干细胞
只能产生一种细胞类型；但是，具有自更新属性，将其与非干细胞区分开。
也有选用单一冷冻保护液的。 Galmes等(1995)首先提出以10% D M S O 为保护液，细胞冷冻后储存于-80℃的方法。 Hemandez-Navarro等 以 10% D M S O 和 H A S 混合物为冷冻保护液，将 装 有 P B S C 的冷冻袋放入9 5 % 甲醇液中，直接置于-80°C 保存，细胞回输后造血恢复情况与其他方法无明显差异。叶韵斌等(2000)对 使 用 10% D M S O 单一保护液和 5 % D M S O + 6 % H E S + 4 % A L B 混合保护液的效果进行比较，发现在冻存180天以内二者差异不大，细胞活力在8 5 % 以上， C D 34+阳性细胞比例、粒单集落数均维持治疗水平。
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干细胞的可塑性越来越多的据表明，当成体干细胞被移植入受体中，它们表现出很强的可塑性。通常情况下，供体的干细胞在受体中分化为与其组织来源一致的细胞。而在某些情况下干细胞的分化并不遵循这种规律。1999年Goodell等人分离出小鼠的肌肉干细胞，体外培养5天后，与少量的骨髓间质细胞一起移植入接受致死量辐射的小鼠中，结果发现肌肉干细胞会分化为各种血细胞系。这种现象被称为干细胞的横向分化（trans-differentiation）。关于横向分化的调控机制目前还不清楚。大多数观点认为干细胞的分化与微环境密切相关。可能的机制是，干细胞进入新的微环境后，对分化信号的反应受到周围正在进行分化的细胞的影响，从而对新的微环境中的调节信号做出反应。 克隆猪、克隆羊，其技术的机制原理和干细胞是一致的。
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造血干细胞是体内各种血细胞的唯一来源，它主要存在于骨髓、外周血、脐带血中。今年年初，协和医大血液学研究所的庞文新又在肌肉组织中发现了具有造血潜能的干细胞。造血干细胞的移植是治疗血液系统疾病、先天性遗传疾病以及多发性和转移性恶性肿瘤疾病的有效方法。在临床治疗中，造血干细胞应用较早，在20世纪五十年代，临床上就开始应用骨髓移植（BMT）方法来治疗血液系统疾病。到八十年代末，外周血干细胞移植（PBSCT）技术逐渐推广开来，大多数为自体外周血干细胞移植（APBSCT），在提高治疗和缩短疗程方面优于常规治疗，且效果令人满意。与两者相比，脐血干细胞移植的长处在于无来源的限制，对HLA配型要求不高，不易受或肿瘤的污染。
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