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脐带血干细胞移植的优点相较于骨髓、外周血干细胞移植等传统的干细胞移植方法，脐带血干细胞移植具有以下优点:
①脐带血中的干细胞浓度及纯度较高，是骨髓干细胞的10—20倍，其增殖能力也远超骨髓干细胞；
②来源方便，新生儿出生时即可收集脐带血；
③治疗费用低、移植准备时间短，尤其适用于病情不稳定、发展迅速的患者；
④脐带血干细胞移植对配型要求的严格程度低于骨髓干细胞移植，所以配型成功率较高；
⑤脐带血淋巴细胞大多数为初始型细胞，其免疫效应分子和受体表达不够完善，因此免疫功能较不成熟，排斥反应发生率较低；
⑥脐带血受胎盘屏障的保护，细胞自身传染病感染率较低；
⑦相较于胚胎干细胞移植来说，脐带血干细胞移植不存在伦理问题。
除内源性调控外，干细胞的分化还可受到其周围组织及细胞外基质等外源性因素的影响。 分泌因子 间质细胞能够分泌许多因子，维持干细胞的增殖，分化和存活。有两类因子在不同组织甚至不同种属中 成体干细胞在体内发育为不同组织都发挥重要作用，它们是TGFβ家族和Wnt信号通路。比如TGF家族中至少有两个成员能够调节神经嵴干细胞的分化。近研究发现，胶质细胞衍生的神经营养因子（GDNF）不仅能够促进多种神经元的存活和分化，还对精原细胞的再生和分化有决定作用。GDNF缺失的小鼠表现为干细胞数量的减少，而GDNF的过度表达导致未分化的精原细胞的累积[3]。Wnts的作用机制是通过阻止β-Catenin分解从而Tcf/Lef介导的转录，促进干细胞的分化。比如在线虫卵裂球的分裂中，邻近细胞导的Wnt信号通路能够控制纺锤体的起始和内胚层的分化。 膜蛋白介导的细胞间的相互作用 有些信号是通过细胞-细胞的直接接触起作用的。β-Catenin就是一种介导细胞粘附连接的结构成分。除此之外，穿膜蛋白Notch及其配体Delta或Jagged也对干有重要影响。在果蝇的感觉器官前体细胞，脊椎动物的胚胎及成年组织包括视网膜神经上皮、骨骼肌和血液系统中，Notch信号都起着重要的作用。当Notch与其配体结合时，干细胞进行非分化性增殖；当Notch活性被抑制时，干细胞进入分化程序，发育为功能细胞。 整合素（Integrin）与细胞外基质 整合素家族是介导干细胞与细胞外基质粘附的主要的分子。整合素与其配体的相互作用为干细胞的非分化增殖提供了适当的微环境。比如当β1整合素丧失功能时，上皮干细胞逃脱了微环境的制约，分化成角质细胞。此外细胞外基质通过调节β1整合素的表达和，从而影响干细胞的分布和分化方向。
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然而，这个观点目前受到了挑战。的研究表明，组织特异性干细胞同样具有分化成其它细胞或组织的潜能，这为干细胞的应用开创了更广泛的空间。按分化潜能的大小，干细胞基本上可分为三种类型:一类是全能性干细胞，它具有形成完整个体的分化潜能。如胚胎干细胞，它是从早期胚胎内的细胞团分离出来的一种高度未分化的细胞系，具有与早期胚胎细胞相似的形态特征和很强的分化能力，它可以无限增殖并分化成为全身200多种细胞类型，进一步形成机体的组织、器官。另一类是多能性干细胞，这种干细胞具有分化出多种细胞组织的潜能，但却失去了发育成完整个体的能力，发育潜能受到一定的限制，骨髓多能造血干细胞是典型的例子，它可分化出至少十一中血细胞，但不分化出造血系统以外的其他细胞。还有一类干细胞为单能干细胞（也称专能、偏能干细胞），这类干细胞只能向一种类型或密切相关的两种类型的，如上皮组织基底层的干细胞、肌肉中的成肌细胞。
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牙髓干细胞是具有多能分化和自我更新能力的间充质干细胞，早从恒牙牙髓中分离出来，来自孩子脱落的乳牙也可以分离出牙髓干细胞。牙髓干细胞，具有自我更新和多向分化的能力，且易于获得、可通过性常规临床操作分离、伦理问题较少，与典型的骨髓间充质干细胞相比，无论是再生潜能还是增殖能力均较高。但其细胞量很少，应用暂时不是很广泛。脂肪间充质干细胞脂肪间充质干细胞取自健康(18至45岁)抽脂手术所得脂肪组织，具有较强的体外增殖能力，具有生物学特性稳定、来源充足、 体外培养条件低等优势。目前，研究人员已成功地在体外将其导为内皮细胞，成骨细胞、成软骨细胞、脂肪前体细胞、平滑肌细胞，心肌细胞、神经样细胞等。
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